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技術服務 >服務專題 >非編碼RNA研究 >環狀RNA研究
環狀RNA研究

簡介:

環狀RNA (circRNA)是一類不具有 5' 末端帽子和 3' 末端 poly(A)尾巴、并以共價鍵形成環形結構的非編碼 RNA 分子。 環狀RNA (circRNA) 是區別于傳統線性 RNA 的一類新型 RNA,大量存在于真核轉錄組中且表達具有時空特異性。在調控基因轉錄、作為疾病診斷marker等方面具有重要的研究和臨床意義。 


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環狀的RNA主要特征:

(1)circRNA由特殊的可變剪切產生,大量存在于真核細胞的細胞質中,但少部分內含子來源的circRNA則存在于核酸內,具有一定的組織、時序和疾病特異性;

(2)廣泛存在于人體細胞中,有時甚至超過它們線性異構體的10倍之多;

(3)與傳統的線型RNA不同,circRNA分子呈封閉環狀結構,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比線性RNA更穩定;

(4)具有高度保守性,部分具有快速的進化性改變;

(5)大多數來源于外顯子,少部分由內含子直接環化形成;

(6)可以翻譯成蛋白質,但大部分是非編碼RNA

 

環狀RNA的主要類型:

環狀RNA示意圖 

Annot_exon:環狀RNAbreakpoint位于已知基因的一個外顯子的起始和另外一個外顯子的終止,其序列由breakpoint之間的外顯子的堿基構成。

One_exon:環狀RNA位于已知基因的某一個外顯子內,其序列由breakpoint之間的所有堿基構成。

Exon_intron:環狀RNAbreakpoint之間有已知基因的一個或多個完成外顯子但breakpoint不位于已知外顯子的起始或終止,其序列由上breakpoint起始位點到第一個外顯子起始位點、breakpoint之間的外顯子和最后一個外顯子到breakpoint終止位點的堿基構成。

Intronic:環狀RNA位于已知基因的某一個內含子內,其序列由breakpoint之間的所有堿基構成。

Antisense:環狀RNA位于已知基因的反義鏈,其序列由反義鏈上breakpoint之間的所有堿基構成。

Intergenic:環狀RNA位于已知基因的之間,其序列由breakpoint之間的所有堿基構成。。

案例展示:




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